Dentro del Cantón en aproximadamente el 80 % de su jurisdicción geográfica, es parte integral de una de las áreas protegidas más importantes del Ecuador, el Parque Nacional Machalilla, que tiene por finalidad la conservación de los recursos naturales y culturales especialmente dentro de las 55.092 hectáreas que posee y sus zonas de amortiguamiento. Fue creado en el año de 1979 persigue entre otros objetivos, conservar y recuperar los ecosistemas terrestres y marinos, incluyendo valores ecológicos y bellezas escénicas de la costa y preservar recursos arqueológicos del área que representa una impugnable riqueza cultural e histórica en la costa ecuatoriana. Sus límites empiezan en Puerto Cayo, al norte hasta el Río Ayampe al sur, al interior de la costa limita con la parte norte de la cordillera Chongon Colonche. El área del Parque comprende además, la Isla Salango y la Isla de la Plata, localizada a 40km, aproximadamente de Puerto Cayo y el área marina de dos millas náuticas, a partir del perfil costanero y del perímetro de las Islas.
El centro administrativo del Parque Nacional Machalilla esta localizado en Puerto López, y se puede obtener información.
En el Parque Nacional Machalilla se distinguen cuatro zonas: Matorral Desértico Tropical, Monte Espinoso Tropical, Bosque Seco Tropical y Monte Espinoso Premontano.
Flora.- Según la clasificación del Holdridge, a la Unidad de Manejo del Parque le corresponde 4 zonas de Vida, incluyendo la zona de Vida del Bosque seco Tropical. Que se encuentra en estado casi primario único a lo largo de la costa ecuatoriana. Una abundantes propuesta de especies florísticas, orquídeas y bromelias entre otras podemos observar en el área.
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Fauna.- Dentro del área observamos Fauna desde la playa hasta la parte alta. Entre ellos tenemos varias especies de mamíferos, Avifauna con una rica e interesantes variedad de especies, reptiles y otras que dan la impresión de ser un zoológico en estado natural.
Arqueología.- En el parque existió el asentamiento del Señorío Manteño de Salangome, que en su época de mayor apogeo llego a cerca de 600 edificaciones. Los mas destacados elementos de la cultura Manteña son observables en los Museo de Agua Blanca y Salango. Los museos sintetizan la historia regional del Sur occidente de la Provincia de Manabí, desde la sociedad Valdivia hasta la Manteña, presentándonos mas de 5000 años de ocupación permanente.
Playas. El recurso playa dentro de esta zona es importante, ya que se cuenta con un buen numero de ellas, principalmente de uso exclusivo para el Ecoturismo, como Los Frailes, la cual cuenta con un sendero para caminata, en el que se observa Playas, Acantilados, Islotes, Fauna, Flora, material arqueológico, paisajes marino costero, y aguas tranquilas y transparentemente que acogedoramente invitan a permanecer por un buen tiempo en su entorno mágico.
Paisajes.- El mayor atractivo del Parque son sus paisajes como hermosas playas como bahías, acantilados e islotes en estado natural. Las playas más importantes son: Los frailes, Salaite, la Playita, los Bálsamos. Los islotes que forman el parque son: Sucre, Sombrerito, Pedernales, Horno de Pan y La Isla Salango y de la Plata.
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